农产品免税是针对农业生产者，13%税率是针对收购并销售者的。免税农产品购进不需要缴纳增值税，可以抵扣13%；生产加工后又出售农产品的要交纳增值税；只有蔬菜和部分鲜活肉蛋产品流通环节免征增值税，其余购买的农产品再销售不得免征增值税。法律依据：《中华人民共和国增值税暂行条例》第十五条第一款下列项目免征增值税：(一)农业生产者销售的自产农产品；(二)避孕药品和用具；(三)古旧图书；(四)直接用于科学研究、科学试验和教学的进口仪器、设备；(五)外国政府、国际组织无偿援助的进口物资和设备；(六)由残疾人的组织直接进口供残疾人专用的物品；(七)销售的自己使用过的物品。

可以抵扣的发票有:增值税专用发票(开具固定资产发票除外),运输发票,收购(农产品)发票,废旧物质,海关增值税,中国国内的铁路运输发票。而且要符合一般纳税人资格才能抵扣,小规模纳税人是不能抵扣的。所以不管发票是否达到一定量,只要符合资格就能抵扣了。法律依据：《财政部国家税务总局海关总署关于深化增值税改革有关政策的公告》六、纳税人购进国内旅客运输服务，其进项税额允许从销项税额中抵扣。（一）纳税人未取得增值税专用发票的，暂按照以下规定确定进项税额：1.取得增值税电子普通发票的，为发票上注明的税额；2.取得注明旅客身份信息的航空运输电子客票行程单的，为按照下列公式计算进项税额：航空旅客运输进项税额=（票价+燃油附加费）÷（1+9%）×9%；3.取得注明旅客身份信息的铁路车票的，为按照下列公式计算的进项税额：铁路旅客运输进项税额=票面金额÷（1+9%）×9%；4.取得注明旅客身份信息的公路、水路等其他客票的，按照下列公式计算进项税额：公路、水路等其他旅客运输进项税额=票面金额÷（1+3%）×3%；（二）《营业税改征增值税试点实施办法》（财税〔2016〕36号印发）第二十七条第（六）项和《营业税改征增值税试点有关事项的规定》（财税〔2016〕36号印发）第二条第（一）项第5点中“购进的旅客运输服务、贷款服务、餐饮服务、居民日常服务和娱乐服务”修改为“购进的贷款服务、餐饮服务、居民日常服务和娱乐服务”。

普通发票不能抵扣。只有一般纳税人企业取得可抵扣的增值税专用发票才能抵扣其进项税。增值税纳税人使用的发票由国家税务局管理，分为普通发票和增值税专用发票两大类，小规模纳税人不得领购使用增值税专用发票，只能使用普通发票。法律依据：《中华人民共和国增值税暂行条例》第八条纳税人购进货物、劳务、服务、无形资产、不动产支付或者负担的增值税额，为进项税额。下列进项税额准予从销项税额中抵扣：（一）从销售方取得的增值税专用发票上注明的增值税额。（二）从海关取得的海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额。（三）购进农产品，除取得增值税专用发票或者海关进口增值税专用缴款书外，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和11%的扣除率计算的进项税额，国务院另有规定的除外。进项税额计算公式：进项税额=买价×扣除率（四）自境外单位或者个人购进劳务、服务、无形资产或者境内的不动产，从税务机关或者扣缴义务人取得的代扣代缴税款的完税凭证上注明的增值税额。准予抵扣的项目和扣除率的调整，由国务院决定。