杨芃原教授:糖蛋白结构的质谱分析
导读:
7月30日至8月1日,2010年全国质谱会暨第三届世界华人质谱研讨会在吉林省长春市召开,本届大会共有近600位质谱相关人士参加,来自海内外的华人顶级质谱专家、学者在会上大家带来了精彩的学术报告
复旦大学杨芃原教授
复旦大学杨芃原教授在本届大会上演讲了题为"糖蛋白结构的质谱分析",重点介绍了MALDI质谱技术对糖蛋白de-novo进行解谱和使用ESI搜索糖蛋白据库的糖蛋白结构鉴定方法两方面的内容。
杨教授介绍到,理论上的糖蛋白数据库数目是天文数字,通过增加各谱图阶段的信息,减少检索时需要的已知信息,并编写新的检索程序,是建立糖蛋白数据库的有效途径之,为此,他所在的课题组还提出了具体建立步骤:
(1)建立完备、精简的包含糖位点的肽库及糖链库,通过实验获得肽库,根据文献获得糖链最大组成的糖链库,列举它们的结构后,再人工排除不合理结构,获得针对特定样品的糖链库;
(2)构建针对特定样品的糖结构库;
(3)筛选出谱图中可能的糖碎裂峰;
(4)对碎裂峰进行匹配,获得糖肽组成,使用上一步骤获得峰连续碎裂网络,对网络中的个路径进行批量分析,再根据解的重复性判断可靠性。
在报告中,杨教授还通过举例向大家介绍了糖蛋白结构的具体确定过程。
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